Petar Vasiljević tras no poder sacar al equipo navarro del descenso, dejó el club. El equipo confirmó su descenso matemáticamente a Segunda División el 26 de abril de 2017 tras perder contra el Barcelona por un (7-1), Su último partido en Primera División sería contra el Sevilla FC con un (5-0) a favor del Sevilla, el club finalmente terminó la temporada en la posición 19° con 22 puntos, cuatro victorias, diez empates y veinticuatro derrotas.